Le comité de direction, présidé par le directeur du projet, constitue la seconde instance de gouvernance composée de M. François Féral de l’Université de Perpignan, M. Ghislain Otis, titulaire de la Chaire de recherche du Canada sur la diversité juridique et les peuples autochtones, et l’ancienne chef atikamekw Mme Eva Ottawa. Garant du respect des principes de la recherche autochtone, le comité a compétence pour toute matière liée au fonctionnement du projet et est le responsable ultime relativement à l’avancement des travaux.